Институт Қазақстан, Ресей, Түркия және Әзірбайжан елдерінің Топырақтану жөніндегі халықаралық қоғамының тең құрылтайшысы, ТМД елдерінің "Агрохимэкосудружествосының" мүшесі, ФАО-ның жаһандық топырақ серіктестігі мен Еуразиялық топырақ серіктестігінің мүшесі болып табылады.
Институт қазіргі уақытта 150-ден астам елдегі 800-ден астам зертханаларды қамтитын glosolan топырақ зертханаларының ғаламдық желісінің құрамына кірді. Серіктестіктің мақсаты-зертханалардың әлеуетін арттыру және топырақты зерттеудің заманауи әдістерін бейімдеу
Институтта жақын және алыс шет елдермен халықаралық қатынастар қарқынды дамып келеді, төменде халықаралық ынтымақтастық туралы жасалған шарттардың тізімі келтірілген:
- РМАУ – К.А. Тимирязев атындағы МАША, Ресей Федерациясы;
- Беларусь ҰҒА Топырақтану және агрохимия институты, егін шаруашылығы бойынша Беларусь ҰҒА ҒТО, Беларусь Республикасы;
- Ганновер Университеті Лейбниц атындағы топырақтану институт, Германия;
- KTG GLOBAL CO.LTD, Корея;
- «Топырақтың сапасын, құрамын және репозиторийін талдау орталығы» МБК, Өзбекстан;
- Әзірбайжан ҰҒА Топырақтану және агрохимия институты;
- Украина өсімдік сорттарын сараптау институты, Украина
- В.В. Докучаев атындағы Харьков ұлттық аграрлық университеті;
- Ресей Ғылым академиясының Қиыр Шығыс филиалының «Шығыс Азияның жер беті биотасының биоалуантүрлілігі Федералды ғылыми орталығы» Федералды мемлекеттік бюджеттік ғылыми мекеме (РҒА ҚШБ биоалуантүрлілік ФҒО)
- «Ижевск мемлекеттік ауыл шаруашылығы академиясы» ФМБЖББМ (Ижевск ФМБЖББМ МАША), Ресей;
- «Беларусь Мемлекеттік аграрлық техникалық университеті», Минск;
- «В.В. Докучаев атындағы орталық қара топырақ белдеуі ауыл шаруашылығы ғылыми-зерттеу институты» ФМБҒМ (ФМБҒМ ОҚТБ АШҒЗИ), Воронеж;
- «А.А. Ежевский атындағы Иркутск мемлекеттік аграрлық университеті» ФМБЖББМ, Ресей;
- «Ставрополь мемлекеттік аграрлық университеті» ФМБЖББМ, Ресей.