Библиотека основана 4 февраля 1976 года. Библиотечный фонд, более 25 тыс.единиц, состоит из основного базового фонда Национальной библиотеки Академии наук Республики Казахстан, периодической почвенной, экологической и агрохимической литературы, фонда диссертационных работ и авторефератов, справочных, энциклопедических материалов СССР, советского Казахстана и Республики Казахстан.
В фонде имеются редкие, ценные научные книги по естествознанию, а также классическая почвенная литература, ученых и исследователей раннего периода XIX -XX веков, подаренные Институту А.И.Безсоновым и У.У.Успановым, В.М.Боровским, К.Ш. Фаизовым, В.М. Кан и А.С. Сапаровым.
В библиотечном фонде имеются фундаментальные научные труды: Почвы Казахской ССР – 16 томов, Плодородие почв Казахстана – 7 томов, Труды Института почвоведения АН КазССР – 21 том, научные журналы по почвоведению, агрохимии, экологии и др., а также журналы республиканских научных издательств за более чем 70-летний период.
В Институте проводится перевод фонда библиотеки в цифровой и электронный формат, т.е. перевод книг, журналов и других документов на твердых носителях в электронную форму в целях сохранности оригиналов и повышения качества обслуживания пользователей.
В научной библиотеке один читальный зал.
Библиотека обслуживает научных сотрудников, студентов Вузов: в будние дни: понедельник – пятница с 9.30 до 17.30; перерыв с 13.00 до 14.00
Суббота, Воскресенье - выходной день
Последний рабочий день месяца - санитарный день